Основната разлика между простагландин Е1 и Е2 е, че простагландинът Е1 (PGE1) е противовъзпалителен фактор, докато простагландин Е2 (PGE2) е противовъзпалителен фактор.
Простагландините са съединения, получени от липиди, които имат хормоноподобна функция. Те могат да действат като автокринни или паракринни съединения, предизвиквайки антагонистични или синергични ефекти в живите организми. Простагландин Е1 и простагландин Е2 са два вида и се различават по функционалността при възпаление. И двете простагландин Е1 и Е2 принадлежат към едно и също семейство простагландин Е2 и тяхната основа на реакция и техните ефекти все още не са изяснени напълно. Те се използват при лечението на различни биохимични механизми при живите същества.