Ключовата разлика между гликоген и глюкоза е, че гликогенът е полизахарид, който съхранява въглехидрати в животни и гъби, докато глюкозата е най-разпространеният монозахарид, който работи като основен източник на енергия в клетките.
Въглехидратите са органични съединения, характеризиращи се с въглеродни, водородни и кислородни елементи. Съотношението на водорода към кислорода е 2: 1 във въглехидратите, подобно на водата. Въглехидратите са много важни широко разпространени биологични съединения, тъй като те са основният източник на енергия и структурната съставка на протоплазмата. Като цяло въглехидратите са бели, твърди и разтворими в органични течности, с изключение на някои полизахариди. Монозахаридите са основните единици на въглехидратните молекули и глюкозата е най-важната от тях. Гликогенът също е въглехидрат. Но това е полизахарид, образуван от анаболизма на молекулите на глюкозата в разклонена молекула. Както глюкозата, така и гликогенът са важни за производството на енергия в организма. Глюкозата е основното гориво за производство на енергия, а гликогенът е вторичен вид,дългосрочно съхранение на енергия при животни и гъбички.
