Ключовата разлика между лекарствената химия и фармацевтичната химия е, че медицинската химия се занимава с проектирането, оптимизирането и разработването на нови химични съединения, за да ги използва като лекарства, докато фармацевтичната химия се занимава с изследване на лекарствата и тяхното развитие.
Както лекарствената химия, така и фармацевтичната химия се занимават с лекарствата или лекарствата, които използваме за лечение на различни заболявания. И двете области обсъждат проектирането и разработването на лекарства с много малки разлики. Една такава разлика е, че медицинската химия изследва не само лекарствата, но и механизмите на действие на тези лекарства в тялото ни.
