Ключова разлика - Генотипиране срещу последователност
Генотипирането и секвенирането са две техники, извършвани за получаване на информация за нуклеиновите киселини, главно ДНК на организма. Ключовата разлика между генотипирането и секвенирането е, че генотипирането е процес на определяне кой генетичен вариант притежава индивидът, използвайки маркери, докато секвенирането е определянето на правилния ред на нуклеотидната последователност в дадения фрагмент от ДНК.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е генотипиране
3. Какво е секвениране
4. Успоредно сравнение - Генотипиране срещу секвениране
5. Резюме
Какво представлява генотипирането?
Генотипирането е определяне на генетичния състав на индивида с помощта на последователност от ДНК и маркери и сравнение и идентифициране на неговото наследяване. Генотипизирането е важно в еволюционната биология, популационната биология, таксономията, екологията и генетиката на организмите. Може да се извърши чрез различни техники, включително ДНК секвениране, полимеразна верижна реакция, полиморфизъм на рестрикционните фрагменти (RFLP), случайно усилено полиморфно откриване, полиморфизъм на амплифицирана дължина на фрагменти (AFLP), ДНК микрочипове и др.
Генотипирането включва секвениране на определени малки фрагменти от ДНК последователности и откриване на родственост на генетичния състав с други индивиди, използващи генетични маркери. Той определя единичните нуклеотидни полиморфизми (SNP) сред индивидите или специфичните алели. Генотипирането е приложимо за широк спектър от организми, включително хора. Той е приложим и за микроорганизми като вируси, гъби и др. И може да се използва за определяне на техните генетични варианти с референтните профили. В молекулярната епидемиология и съдебната микробиология контролирането на патогени, особено микроорганизми, се извършва чрез информацията, получена от генотипирането. Генотипизирането е много важно при родословния анализ. Хората са генотипизирани, за да потвърдят майчинството и бащинството. Генотипът ще разкрие доминиращите и рецесивни алели на гени, които решават специфични черти.
Фигура_1: Генотипиране на RFLP
Какво е секвениране?
Секвенирането е процес на определяне на правилния ред на нуклеотида в даден фрагмент от ДНК или РНК. На практика цялата информация, необходима за растежа и развитието на организма, е кодирана в неговия геном. Наличието на техники за получаване и отделяне на няколкостотин нуклеотидни дълги фрагменти от нуклеинови киселини доведе до разработването на процедури за определяне на точната нуклеотидна последователност на даден фрагмент от ДНК или РНК. Днес се предлагат различни видове методи за секвениране. Тези методи за секвениране, заедно с технологиите за изграждане на геномни библиотеки, представляващи целия геном на организма, улесняват секвенирането на целия геном на този организъм, като правят задълбочен анализ на генните структури, генните функции, местоположението на гените, генните експресии, картографиране на гени, генни регулаторни региони и др.
Общите геноми на много вируси, няколко бактерии, архебактерии, дрожди и няколко други организми са секвенирани и картографирани. Проектът за човешкия геном направи възможно последователността и картографирането на целия човешки геном и публикуването на първия му проект през 2003 г. Това е важен етап в напредъка на биологията. Последователностите на човешкия геном сега се използват в медицинския сектор за идентифициране на генетични причини за редки заболявания, скрининг на риска от заболявания при новородени, идентифициране на генетични подробности за различни видове рак, разработване на нови терапевтични средства и разработване на нови диагностични инструменти и др
В растителния свят оризовият геном и геномите на Arabidopsis са секвенирани. Познаването на тези последователности несъмнено ще революционизира нашето разбиране за това как функционират клетките и организмите.
Фигура_2: Авторадиография на последователността на sanger
Каква е разликата между генотипирането и секвенирането?
Различна статия Средна преди таблица
Генотипиране срещу последователност |
|
| Генотипирането е процес на определяне на генетичния състав на индивида и проверка на групата или таксономията на този организъм. | Секвенирането е процес на определяне на точния ред на нуклеотиди на даден ДНК или РНК фрагмент. |
| Техники | |
| RFLP, секвениране на гени, PCR, ДНК микрочипове, AFLP и др. | Последователност на Sanger, последователност на Gilbert, Pyro последователност, последователност от следващо поколение, последователност на пушки и др. |
| Основни проблеми | |
| Това е по-загрижено дали разликите в генотипа дават действителните разлики във фенотипа. | Това е по-загрижено за реда на нуклеотидите и неговите различия и промени с други организми. |
Резюме - Генотипиране срещу последователност
Генотипирането и секвенирането са полезни за изучаване на генетичната информация на организмите. Генотипирането е процес на определяне на вариациите на генотипа сред индивидите и намиране на техните категории. Секвенирането е процес на определяне на правилния ред на нуклеотидите в заинтересувания фрагмент или региона на ДНК. И двете техники предоставят важна информация за гените и геномите.
