Ключовата разлика между яйчниковия цикъл и менструалния цикъл е, че яйчниковият цикъл е цикълът, който се случва в яйчниците, докато менструалният цикъл е цикълът, който се случва в матката, свързан с маточната стена.
Овариалният цикъл и менструалният цикъл са два цикъла, срещащи се при жените. Тези два цикъла подготвят жената да забременее и да роди потомство и да стане майка. И двата цикъла се срещат в женската репродуктивна система. По този начин те са хормонално отзивчиви цикли. Жените преминават през тези два цикъла от пубертета до менопаузата. Поредицата от събития се случват по време на тези два цикъла и те се движат главно от хормоните. Когато настъпи бременността, двата цикъла ще спрат и това се прави от хормона, наречен човешки хорион гонадотропин (hCG).