Ключовата разлика между прости протеини и конюгирани протеини е, че прости протеини са изградени от аминокиселини, свързани заедно, за да образуват голяма молекула, докато конюгираните протеини са сложни молекули, съдържащи прости протеини и непротеинови компоненти.
Протеинът е биополимерна молекула. Това означава; протеинова молекула съдържа редица повтарящи се единици, свързани към ковалентни връзки. Тези повтарящи се единици представляват аминокиселините, които са били използвани при образуването на протеина. Според химичния състав на протеините има два вида протеини като прости протеини и конюгирани протеини.
