Ключовата разлика между протеин киназа А и протеин киназа С е, че протеин киназата А е вид протеин киназа, която зависи от цикличния AMP, докато протеин киназа С е подсемейство протеинкинази, което реагира на липидната сигнализация.
Киназата е ензим, който катализира трансфера на фосфатна група от високоенергийни, донорни фосфати молекули към специфични субстрати. Ние наричаме този процес фосфорилиране. Киназите регулират по-голямата част от клетъчните пътища, включително трансдукция на сигнала. Протеинкиназите са специфичен вид кинази, които катализират фосфорилирането на протеини или прехвърлят фосфат към прецизни субстратни протеини. Тези ензими регулират биологичната активност на протеините чрез фосфорилиране на специфични аминокиселини с фосфатни групи от АТФ. След като настъпи фосфорилиране, неактивните протеини се трансформират в активни протеини поради конформационната промяна. Протеин киназа С и протеин киназа А са два вида семейства протеин кинази, които принадлежат към подсемейството: AGC киназа на протеинкинази.