Ключовата разлика между епистатичния ген и хипостатичния ген е, че епистатичният ген е ген, който влияе върху експресията на друг ген в различен локус, докато хипостатичният ген е генът, който подлага на намесата на епистатичния ген.
Някои гени зависят от други неалелни гени за тяхната експресия. Епистазата е форма на генно взаимодействие, при която един ген пречи или маскира експресията на друг ген, разположен в различен локус. Следователно, това е вид неалелно взаимодействие между гените. В това специално взаимодействие между гените два гена си взаимодействат и те са епистатичният и хипостатичният ген. Съответно, генът, който маскира експресията на друг ген, е известен като епистатичен ген, докато генът, чиято експресия е засегната, е известен като хипостатичен ген.
