Ключовата разлика между кандидат-гена и GWAS е, че подходът ген-кандидат изследва генетичната вариация в рамките на малък брой предварително зададени гени, които представляват интерес, докато GWAS изследва целия геном за обща генетична вариация зад определено заболяване.
Кандидат генният подход и проучванията за асоцииране в целия геном (GWAS) са два метода, които са важни за откриване на генетична чувствителност към заболявания. Кандидат генният подход се основава на предварително определен малък брой гени, докато GWAS се основава на тестване на целия геном. Следователно, кандидат генният подход изисква предварително познаване на гени, имащи отношение към заболяването, за разлика от GWAS.
