Ключовата разлика между алогенна и автоложна трансплантация зависи от източника на стволови клетки за трансплантация. Алогенната трансплантация използва нови стволови клетки от различен донор, докато автоложната трансплантация използва собствени стволови клетки на пациента.
Стволовите клетки са недиференцирани клетки, които могат да се разделят и диференцират в различни други видове клетки. Следователно тези клетки имат способността да се самообновяват. Следователно те са основата за нашите органи и тъкани. Освен това те действат като система за възстановяване на нашето тяло. Тъй като стволовите клетки са способни да произвеждат повече дъщерни клетки от същия тип или да се диференцират в специфични клетъчни типове, те се използват при терапии със стволови клетки за заместване на неправилно функциониращи или болни тъкани със здрави тъкани. Терапията със стволови клетки може да бъде алогенна или автоложна. Зависи от новите стволови клетки, използвани за заместване на тъканта при трансплантация. В терапията със стволови клетки, ако използваните стволови клетки са собствени на пациента, това е известно като автоложна трансплантация. Но ако е от различен донор, тогава се нарича алогенна трансплантация.
