Ключовата разлика между автоложна и алогенна трансплантация на стволови клетки е, че при автоложна трансплантация на стволови клетки се използват собствени клетки при трансплантация, докато при трансплантация на алогенни стволови клетки донорът се сравнява преди трансплантацията и след това се прилага.
Трансплантацията на стволови клетки е техника, използвана главно за лечение на рак. При трансплантацията на стволови клетки се прилагат стволови клетки с подходящи усъвършенствани характеристики, така че те да се развият в имунологични клетки, способни да унищожат раковите клетки. Другата му функция е да предпазва не-злокачествените клетки в тялото. Автоложната и алогенна трансплантация на стволови клетки са два вида техники за трансплантация на стволови клетки. Автоложната трансплантация на стволови клетки използва собствени стволови клетки за трансплантацията, докато алогенната трансплантация на стволови клетки използва стволови клетки на съответстващ донор.
