Ключовата разлика между тестването на ДНК на майката и бащата зависи от вида на ДНК източника, използван в процедурата за тестване. Тестването на ДНК на майката използва ДНК на митохондриите за получаване на майчинство, докато тестването на ДНК на бащата използва Y-ДНК за получаване на бащински произход.
Определянето на предците както при мъжете, така и при жените са важни, за да се определят семейните взаимоотношения. Освен това тестовете за ДНК на майката и бащата също определят самоличността на индивидите. Някои от молекулните техники, използвани в този анализ, са ДНК пръстови отпечатъци, анализ на кратки тандемни повторения и полиморфизъм на дължината на рестрикционния фрагмент (RFLP).
