Ключовата разлика между файловата система и базата данни е, че файловата система управлява само физическия достъп, докато базата данни управлява както физическия, така и логическия достъп до данните.
Базата данни и файловата система са два метода, които помагат за съхраняване, извличане, управление и манипулиране на данни. И двете системи позволяват на потребителя да работи с данни по подобен начин. Файловата система е колекция от файлове с необработени данни, съхранявани в твърдия диск, докато базата данни е предназначена за лесно организиране, съхраняване и извличане на големи количества данни. С други думи, базата данни съдържа пакет от организирани данни, обикновено в цифрова форма за един или повече потребители. Съкращението от базата данни е DB. Възможно е да се класифицират DB според тяхното съдържание, като документ-текст, библиографски и статистически. Важно е да се отбележи, че дори в база данни данните в крайна сметка или физически се съхраняват в някои файлове.
