Ключовата разлика между последователността на целия геном и секвенцията на екзома е, че цялата секвенция на генома секвенира целия геном на организма, докато секвенцията на екзома секвенира само екзома или кодиращите протеина гени на организма.
Последователността е техника, която определя точния ред на нуклеотидите в определена молекула на ДНК. Той просто отразява правилния ред на четирите бази; аденин (А), гуанин (G), цитозин (С) и тимин (Т) в ДНК фрагмент. Има няколко метода за секвениране, като секвениране на Сангер, секвениране от следващо поколение и др. Освен това, или пълният геном на организма (цялостно геномно секвениране), или само протеиновите кодиращи гени в генома (екзомно секвениране) могат да бъдат подложени на секвениране.