Ключовата разлика между приликата и идентичността при подравняването на последователността е, че приликата е подобие (прилика) между две последователности в сравнение, докато идентичността е броят на символите, които съвпадат точно между две различни последователности.
Биоинформатиката е интердисциплинарна област на науката, която включва основно молекулярна биология и генетика, компютърни науки, математика и статистика. Подравняването на последователността е основен термин в биоинформатиката. Това е процедурата, при която последователностите на ДНК, РНК или протеин са подредени, за да идентифицират области на прилика, която е следствие от функционална, структурна или еволюционна връзка между последователностите. В края на подравняването те ще бъдат представени като редове в матрица. За да се подредят идентичните символи в последователни колони, между остатъците има вмъкнати празнини.
