Ключова разлика - Бактериални транспозази срещу ретровирусни интегрази
Транспортируемият генетичен материал се е развил с две основни стратегии за преместване от един регион в следващия регион вътре и между геномите. Единият метод е да се измести през РНК молекула преди образуването на ДНК молекула, докато другият път включва ДНК междинни продукти. Транспозазите и вирусните интегрази са примери за такъв транспонируем генетичен материал. Бактериалните транспозази се свързват с края на транспозоните и улесняват катализа на движението на транспозона в друга част от генома чрез различни механизми. Ретровирусните интегрази са ензими, които подпомагат интегрирането на генетичния материал на ретровируса като ХИВ в генетичния материал (ДНК) на заразената клетка гостоприемник. Това е ключовата разлика между бактериалните транспозази и ретровирусните интегрази.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Преглед и ключова разлика
2. Какво представляват бактериалните транспозази
3. Какво представляват ретровирусните интегрази
4. Прилики между бактериалните транспозази и ретровирусни интегрази
5. Сравнение едно до друго - Бактериалните транспозази срещу ретровирусните интегрази в таблична форма
6. Резюме
Какво представляват бактериалните транспозази?
Транспозазата може да се определи като ензим, свързан към края на транспозоните, който улеснява катализа на движението на транспозона към друга част от генома чрез различни механизми. Такива механизми включват „механизъм за изрязване и поставяне“и „механизъм за репликативно транспониране“. Транспозазата е въведена за първи път чрез клониране на ензима, който е необходим за транспонирането на Tn3 транспозона. Две важни стратегии са използвани от транспонируемите генетични елементи за изместването между геноми или от едно място на друго. Транспортът през междинно съединение на РНК преди синтеза на ДНК копие е една от стратегиите, докато другата е свързана само с междинните продукти на ДНК. Рекомбинационните реакции, които участват в интеграцията на двата елемента, се осъществяват благодарение на специфични за елементите ензими. Поради това,в случай на ДНК елементи, тези ензими са известни като транспозази, докато в случай на РНК елементи, те са известни като интегрази.
Когато се сравняват разликите между двете стратегии за транспониране, процесът на вмъкване изглежда химически идентичен. Но последните доказателства предполагат, че някои прилики в механизма на интеграция се наблюдават в регионите на аминокиселинните последователности, които образуват активно място; мотивът DDE. В момента се класифицират пет семейства транспозази, но броят на семействата тепърва ще се увеличава с нови символи на транспозаза. Семействата включват DDE транспозаза, тирозин (Y) транспозаза, серин (S) транспозаза, търкалящ се кръг транспозаза, обратни транскриптази / ендонуклеази (RT / En) и др. Тези семейства използват уникални каталитични механизми за разрушаване и повторно свързване на ДНК. DDE транспозазата включва механизма за изрязване и поставяне на оригиналния транспозон и носи три групи консервирани аминокиселини, а именно;аспартат (D), аспартат (D) и глутамат (E). Тирозиновите транспозази също участват в механизма за нарязване и поставяне чрез оползотворяване на остатъка от тирозин, който е специфичен за мястото.
Фигура 01: Бактериални транспозази
Сериновите транспозази включват междинно съединение на кръгова ДНК и изпълняват механизма за изрязване и поставяне, точно както горните семейства. Транспозазата на подвижния кръг включва механизъм за копиране, при който единична верига се копира директно в целевото място чрез репликация на ДНК. Това гарантира, че направлението на шаблона и копираното направление имат направление, което е ново синтезирано. Транспозазата с обратни транскриптази / ендонуклеази има различни механизми за транспониране.
Какво представляват ретровирусните интегрази?
В контекста на ретровирусна интеграза, тя се разглежда като ретровирусен ензим, който подпомага интегрирането на генетичния материал на ретровирус като ХИВ в генетичния материал (ДНК) на заразената клетка. Тези ретровирусни интегрази най-често се бъркат с фагови интегрази. Примери за фагови интегрази са λ фаговите интегрази. Но това са напълно различни ензими и с тях не бива да се бърка. По отношение на образуването на ретровирусен преинтеграционен комплекс, ретровирусната интеграза играе основна роля. Ретровирусните интегразни протеини обикновено се състоят от три (03) канонични домена. Тези домейни са свързани чрез гъвкави линкери.
Трите домени включват N терминал цинк-свързващ домен, където три спирални пакети са свързани и стабилизирани чрез координация с участието на Zn 2+катион, RNase H пъти каталитичен ядрен домен и С терминален ДНК свързващ домен, който е SH3 пъти. Чрез изследване и чрез биохимична и структурна информация, това предполага, че ретровирусната интеграза има способността да функционира като димер на димери (тетрамер). В контекста на мултимеризация и свързване на вирусна ДНК и трите домена на ретровирусния интегразен протеин. Основната функция на ретровирусната интеграза е да вмъкне нейния генетичен материал за приемна ДНК. Тази стъпка е най-важната стъпка във вирусната репликация на ХИВ вируса. След като бъде успешно интегрирана, тя ще бъде там в хромозомната ДНК на клетката през останалата част от живота си.
Фигура 02: Ретровирусни интегрази
Следователно, след като се интегрира, няма връщане за клетката. Тези ретровирусни интегрази участват в катализирането на две основни реакции, включително 3 'крайна обработка и ковалентно лигиране. По време на 3 'крайна обработка, 2-3 нуклеотида от двата 3' края на вирусната ДНК се отстраняват с намерението да се разкрият СА динуклеотидите на 3 'краищата на вирусната ДНК, а по време на ковалентното лигиране, обработените 3' краища на вирусна ДНК се лигират ковалентно в хромозомната ДНК на гостоприемника.
Каква е приликата между бактериалните транспозази и ретровирусните интегрази?
И бактериалните транспозази, и ретровирусните интегрази имат сходни аминокиселинни последователности
Каква е разликата между бактериалните транспозази и ретровирусните интегрази?
Различна статия Средна преди таблица
Бактериални транспозази срещу ретровирусни интегрази |
|
| Бактериалната транспозаза е ензим, свързан към края на транспозоните, като същевременно улеснява катализа на движението на транспозона към друга част от генома чрез различни механизми. | Ретровирусните интегрази се разглеждат като ретровирусен ензим, който подпомага интегрирането на генетичния материал на ретровируса като ХИВ в генетичния материал (ДНК) на заразената клетка. |
| Обвързващи региони | |
| Необходими са силно специфични региони на свързване за бактериални транспозази. | Необходима е по-малко или никаква нуклеотидна последователност за свързване. |
Резюме - Бактериални транспозази срещу ретровирусни интегрази
Бактериалните транспозази се разглеждат като ретровирусен ензим, който подпомага интегрирането на генетичния материал на ретровирус като ХИВ в генетичния материал (ДНК) на заразената клетка. Две важни стратегии са използвани от транспонируемите генетични елементи за изместването между геноми или от едно място на друго. В момента се класифицират пет семейства транспозази, но броят на семействата тепърва ще се увеличава с нови символи на транспозаза. Ретровирусна интеграза, тя се счита за ретровирусен ензим, който подпомага интегрирането на генетичния материал на ретровирус като ХИВ в генетичния материал (ДНК) на заразената клетка. Ретровирусните интегразни протеини обикновено се състоят от три (03) канонични домена. Основната функция на ретровирусната интеграза е да вмъкне нейния генетичен материал, за да приеме ДНК. Тази стъпка е най-важната стъпка във вирусната репликация на ХИВ вируса. Следователно, след като се интегрира, няма връщане за клетката. Това е разликата между бактериалните транспозази и ретровирусната интеграза.
Изтеглете PDF за бактериални транспозази срещу ретровирусни интегрази
Можете да изтеглите PDF версията на тази статия и да я използвате за офлайн цели според бележката към цитата. Моля, изтеглете PDF версията тук: Разлика между бактериалните транспозази и ретровирусните интегрази
