Ключовата разлика между хроматина и хромозомите е, че хроматинът е разплетена и разгъната ДНК, която съществува като комплекс от ДНК и хистонови протеини, докато хромозомите съдържат най-високата кондензирана структура на ДНК двойната спирала за правилното разделяне на генетичния материал между дъщерните клетки.
Хроматинът и хромозомата са две категории структури на двойната спирала на ДНК, които присъстват в различни етапи на клетката. От съществено значение е да опаковате цялата ДНК, която съхранява генетичната информация на клетката, в еукариотното ядро за съществуване. Следователно, хроматинът е обичайната форма на пакетирана ДНК в клетката. От друга страна, хромозомите са най-важните структури в клетката по време на клетъчното делене и те съдържат генетичния материал под формата на ДНК. Това е така, защото те са отговорни за предаването на наследствена информация от едно поколение на следващото. Има два вида хромозоми като автозоми и полови хромозоми. Половите хромозоми са важни при определянето на пола, докато автозомите определят останалите характеристики. Като цяло, хромозомите се появяват по време на метафаза на клетъчното делене.
