Ключовата разлика между хомоложните и хомеоложните хромозоми е, че хомоложните хромозоми са хромозоми с общ произход, докато хомеологичните хромозоми са хромозоми, които имат двусмислена природа и са частично хомоложни.
Хромозомите са структурните компоненти, които носят генетична информация на организма. Ядреният материал в еукариотите е подреден да образува хромозоми, които са компактни структури на нуклеинови киселини и протеини. Освен това има различни видове хромозоми въз основа на начина, по който те се подлагат на клетъчно делене. Хомоложните и хомеоложните хромозоми са два вида хромозоми, които играят важна роля в областта на генетиката.