Ключовата разлика между Робертсоновата транслокация и изохромозомата е, че Робертсоновата транслокация е форма на хромозомна транслокация, която включва сливането на цели дълги рамена на две акроцентрични хромозоми, докато изохромозомата е необичайна небалансирана хромозома, която има две еднакви рамена поради дублиране на едната ръка и делеция на другия.
Робертсоновата транслокация и изохромозомата са две хромозомни аномалии. При Робертсоновата транслокация някои видове хромозоми са прикрепени един към друг. Това е най-честата форма на транслокация при хората. Изохромозомата, от друга страна, е анормална хромозома, която има две еднакви рамена. Тези рамена на изохромозома са огледални изображения на всеки друг.