Ключовата разлика между биологичния часовник и циркадния ритъм е, че биологичният часовник е вродено устройство за синхронизация на организма, съставено от специфични молекули, които взаимодействат с клетките в тялото, докато циркадният ритъм е физическа, психическа и поведенческа промяна, която следва дневен цикъл.
През нощта се чувстваме сънливи, но сме енергични и оставаме будни през целия ден. Причината за това е циркадният биологичен часовник. Биологичният часовник е нашето вродено устройство за синхронизация, което се контролира от мозъка ни. Циркадният ритъм е естествен и вътрешен процес, който се повтаря приблизително на всеки 24 часа. Циркадният ритъм може да повлияе на цикъла сън / събуждане. Всяка тъкан и орган в нашето тяло работят в съответствие с биологичния часовник и циркадните ритми. Циркадният часовник е жизненоважен регулаторен фактор за почти всички физиологични дейности в нашето тяло. Нарушенията в циркадната система на часовника могат да причинят тежки последици за човешкото здраве.