Ключовата разлика между нокаут и нокаут разчита на метода, използван за създаване на трансгенен организъм. При чукане на ген се вмъква нов ген, докато при генно нокаутиране се извършва премахване на съществуващ ген, за да се създаде трансгенен организъм.
Трансгенните организми са организми с променена генетична конституция. „Рекомбинантните организми“е синоним за тях. В повечето случаи трансгенните организми съдържат полезни характеристики. Когато създават трансгенни организми, гените стават мишена. Според необходимостта ген може да бъде въведен или премахнат. Нокът на ген се отнася до въвеждането на нов ген, докато нокаутът на ген се отнася до премахването на ген.
