Ключовата разлика между храносмилането на протеини в стомаха и тънките черва е, че храносмилането в стомаха се осъществява чрез пепсин и солна киселина, докато храносмилането в тънките черва се извършва от трипсин и химотрипсин, секретирани от панкреаса.
Храната, която консумираме, подлежи на химическо и механично храносмилане в храносмилателната система. След като храната се усвои, хранителните вещества се абсорбират в кръвта ни през тънките черва. Храносмилането на протеини се осъществява на два етапа: в стомаха и в първата част на тънките черва (дванадесетопръстника) чрез протеази. В стомаха пепсинът разгражда протеините до аминокиселини и олигопептиди. По-нататъшното усвояване на олигопептиди в аминокиселини, дипептиди и трипептиди се извършва в тънките черва от панкреатични ензими.
