Ключовата разлика между ДНК ваксината и рекомбинантната ваксина разчита на подготовката на ваксините. Приготвянето на ДНК ваксина се извършва с използване на желани гени или ДНК фрагменти, докато приготвянето на рекомбинантна ваксина се извършва с помощта на рекомбинантна молекула или вектор, съдържащ желания генен фрагмент.
Ваксинациите могат да се използват като профилактични методи за лечение, както и като терапевтични средства срещу инфекция. Има много форми на ваксинации. ДНК и рекомбинантните ваксини са най-новите форми. Освен това тези ваксини все още са в процес на проучване.