Ключовата разлика между класическата теория и квантовата теория е, че класическата теория описва същността на макроскопичното ниво, докато квантовата теория описва природата на микроскопичното ниво.
Класическата теория и квантовата теория са много важни клонове във физическата химия, тъй като можем да ги използваме, за да опишем поведението на обектите. Съществува значителна разлика между класическата теория и квантовата теория, включително предвидимостта на събитията, както и разглеждания обект, т.е. класическата теория се прилага за макроскопични обекти, където квантовата теория описва поведението, ако са микроскопични частици.