Ключовата разлика между паразитните корени и микоризите е, че паразитните корени са корените на нефотосинтетичните паразитни растения, докато микоризите са вид мутуалистична асоциация, която съществува между корените на фотосинтезиращото висше растение и гъбата.
Паразитизмът и взаимността са две симбиотични асоциации, съществуващи между два различни вида, които живеят заедно. Паразитизмът е полезен само за паразита, тъй като паразитът получава храни и други изисквания от гостоприемника, докато му вреди. От друга страна, мутуализмът носи полза и на двамата партньори, които са в асоциацията. Микоризите са вид мутуалистични асоциации, възникващи между висше растение и гъбички. Гъбата живее в корените на висшите растения. Висшите растения осигуряват храни на гъбичките, докато гъбите абсорбират вода и хранителни вещества от почвата до растенията.
