Ключовата разлика между лишеите и микоризите е, че лишеят е мутуалистична асоциация, която съществува между водорасли / цианобактерии и гъбички, докато микоризата е вид мутуалистична асоциация, възникваща между корени на висше растение и гъбички.
Мутуализмът е един от трите вида симбиоза, който се среща между два различни вида организми. За разлика от другите два типа, мутуализмът носи полза и на двамата партньори, които са в асоциацията. Лишейът и микоризата са два често срещани примера на мутуалистични асоциации. И двете са екологично важни взаимоотношения. Две страни на лишеите са водорасли или цианобактерии и гъбички. От друга страна, две страни от микоризата са корени от висше растение и гъбички.
