Основната разлика между ферментацията в твърдо състояние и потопената ферментация е, че ферментацията в твърдо състояние включва култивиране на микроорганизми върху твърд субстрат с ниско съдържание на влага, докато потопената ферментация включва култивиране на микроорганизми в течна среда, която има повече от 95% водно съдържание.
Микроорганизмите са полезни в различни видове индустрии. Бактериите и гъбите имат особено голямо приложение в индустрията. Микроорганизмите трябва да се отглеждат в голям мащаб по време на индустриалния процес на ферментация, за да се извлекат необходимите продукти, получени в резултат на микробния метаболизъм. Ферментацията в твърдо състояние и потопената ферментация са два основни типа ферментация, които спомагат за индустриалното производство на ензими. При ферментация в твърдо състояние ферментацията се осъществява от микроорганизми, отглеждани върху твърд субстрат, докато при ферментация под вода ферментацията се извършва от микроорганизми, отглеждани в течна среда. Всеки метод има както предимства, така и недостатъци.
