Ключовата разлика между стабилизиращата и балансиращата селекция е, че стабилизиращата селекция е вид естествен отбор, който благоприятства средните фенотипове в популация, докато балансиращият селекция е поддържането на множество алели на ген в една популация с цел засилване на генетичното разнообразие.
Стабилизиращата селекция е вид естествен подбор, който се прилага за фенотипна черта. Той благоприятства средните фенотипове в популацията. Следователно, той елиминира двата вида екстремни фенотипове. В крайна сметка това прави еднакво население. Балансиращият подбор е няколко селективни процеса, които поддържат благоприятно генетично разнообразие в популацията чрез поддържане на множество алели на ген. Следователно, той се отнася за генния локус.
