Транспозон срещу Ретротранспозон
Транспозоните и ретротранспозоните са генетични компоненти на ДНК и между тях има големи разлики. Процентното присъствие на тези генетични материали варира в различните видове и техните функции определят съдбите на организма с мутации и други фенотипично важни промени. Транспозоните и ретротранспозоните са гени или колекции от определени гени, разположени в ДНК веригите, и промяната на местоположението им са основните причини за тези последици. Тази статия обаче има за цел да обсъди накратко функциите на тези гени и представя сравнение между транспозони и ретротранспозони.
Какво е Транспозон?
Транспозоните са интересни фрагменти или сегменти на ДНК с възможност за промяна на местоположението на ДНК веригата под формата на механизъм за изрязване и поставяне. Поради тази подвижна природа на транспозоните, те са известни като скачащи гени. Транспозоните са два основни типа, известни като транспозони от клас I и транспозони от клас II. Обикновено типът клас II е посочен като транспозоните, а класът I - ретротранспозоните. Процесите на изрязване и поставяне на подвижни ДНК сегменти се регулират от ензима транспозаза. Ензимът се свързва с двата края на транспозона и прерязва фосфодиестерните връзки на ДНК веригата, изолира транспозона, премества го в целевото място и се свързва на новото място. Този процес обаче е интересен за разбиране,тъй като някои транспозони могат да се придвижват само до определени места само поради несъвместимостта на базовите последователности с целевия сайт. Гените с единия край на единична верига имат същата основна последователност с другия край на другата единична верига са транспозони с лепкави ръбове, тъй като те могат да се свържат с местата на целевата ДНК верига със същата основна последователност, както в лепкавите краища. Тази мобилност на гените обаче може да причини промени в генотипа, както и във фенотипа на организма. Учените, изобретени за транспозоните и генетично модифицираните храни и организми в съответствие с предпочитаните настройки, бяха предоставени на разположение. Високопродуктивни земеделски култури, антибиотици с лечебни свойства,животинските животни са едни от благоприятно разработените продукти след изобретяването на транспозони от Барбара МакКлинток през 40-те години.
Какво е Ретротранспозон?
Ретротранспозоните са транспозони от клас I и те се движат през генома чрез механизма за копиране и поставяне. Механизмът на мобилността на ретротранспозоните включва няколко основни стъпки като копиране на генния сегмент на ДНК веригата в РНК, прехвърляне на копието на РНК в целевото място, транскрипция на РНК последователността обратно в ДНК с помощта на обратна транскриптаза и вмъкване на гена в новото местоположение на ДНК веригата на генома. Двата края на тези ретротранспозони обикновено имат дълги крайни повторения с около 1000 базови двойки и те се използват като идентификационни характеристики на тези гени. Тези гени се амплифицират лесно в генома и процентът на ретротранспозоните в човешкия геном е около 50%. Те могат да бъдат доста опасни, тъй като причинителят на СПИН, ХИВ,и вирусът на Т-клетъчната левкемия имат ретротранспозоните в своите РНК геноми. Всъщност тези вируси могат да свържат ретротранспозоните във всяко място на човешките ДНК вериги с използването на обратна транскриптаза и интеграза. Ензимът интеграза функционира по същия начин като транспозазата при транспозони от клас II.
Каква е разликата между Transposon и Retrotransposon?
• Транспозоните са скачащи гени от клас II, докато ретротранспозоните попадат в категорията от клас I.
• Транспозоните функционират с транспозазния ензим, докато ретротранспозоните функционират с използването на два основни ензима, известни като обратна транскриптаза и интеграза.
• Крайните краища са много по-дълги при ретротранспозони, отколкото при транспозони.
• Транспозоните се изрязват от началото и се поставят в целта; обратно, ретротранспозоните се копират от началото в РНК и се транскрибират в целта.
• Преместването на ретротранспозони включва РНК, но не и в транспозони.
