Ключова разлика - Exome срещу Transcriptome
Генът съдържа кодиращи и некодиращи региони в него. Кодиращите последователности са известни като екзони, а некодиращите последователности са известни като интрони. Нуклеотидната последователност на екзоните на гена представлява генетичния код на гена за синтезиране на специфичния протеин. Следователно екзоните остават в молекулата на иРНК. Общият екзон на генома е известен като екзом и е важна част от генома. Генетичният код на гените се преобразува в генетичния код на иРНК молекулата, който е необходим за производството на протеин. Целите молекули на иРНК, транскрибирани в клетка или клетъчна популация в даден момент, са известни като транскриптоми. Ключовата разлика между екзома и транскриптома е, че екзомът представлява последователностите на екзонните области на генома, докато транскриптомът представлява общата иРНК на клетка или тъкан в даден момент.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е Exome
3. Какво е Transcriptome
4. Успоредно сравнение - Exome срещу Transcriptome
5. Резюме
Какво е Exome?
Гените са съставени от екзони, интрони и регулаторни последователности. Екзоните са генните области, които се транскрибират в иРНК последователност по време на транскрипцията. По време на транскрипцията се премахват интрони и други некодиращи региони. Нуклеотидната последователност на екзоните определя генетичния код на гена, който синтезира специфичния протеин, който кодира. Само екзони остават в mRNA на протеин. Събирането на екзони в генома е известно като екзом на организма. Той представлява част от генома, която се изразява в гени. При хората екзомът представлява 1% от генома. Това е кодиращата протеини част от човешкия геном.
Фигура 01: Екзоме
Какво е Transcriptome?
Транскриптомът е събирането на всички кодиращи и некодиращи протеини транскрипти (РНК) в дадена тъкан. Транскриптомът представлява събирането на общите молекули на иРНК, изразени от гените в клетка или тъкан. Транскриптомът на клетка може да варира с транскриптома от друг тип клетка. Транскриптомът също е динамичен - той се променя с времето в отговор както на вътрешни, така и на външни стимули. Дори в рамките на една и съща тъкан или в същия тип клетки, транскриптомът може да се промени след няколко минути.
Транскриптома се различава от екзома на организма. Транскриптомът включва само изразените екзомни последователности. Въпреки че екзомът на клетката остава същият, транскриптомът се различава между клетките, тъй като генната експресия не е еднаква за всички клетки или тъкани. Само основни гени се експресират в различни клетки и тъкани. Генната експресия е специфичен за тъкан или клетъчен процес. Регулира се от различни фактори, включително фактори на околната среда. Следователно транскриптомът може да варира в зависимост от външните условия на околната среда.
Транскриптомът се използва като предшественик за изследвания на протеомиката. Всички протеини са получени от иРНК последователности. Транслационните модификации могат да доведат до промени в протеините. Въпреки това, транскриптомът предоставя важна основна информация за протеомните изследвания.
Фигура 02: Транскриптом на ембрионални стволови клетки
Каква е разликата между Exome и Transcriptome?
Различна статия Средна преди таблица
Exome срещу Transcriptome |
|
| Exome е събирането на протеин-кодиращ регион на гените. | Транскриптом е събирането на всички транскрибирани РНК, включително иРНК. |
| Проба | |
| Exome се изследва с помощта на ДНК проба. | Транскриптомът се изследва с помощта на РНК проба. |
| Метод на изследване | |
| Последователността на цели екзоми е методът за изучаване на екзома. | РНК секвенирането е метод за изучаване на транскриптома. |
Резюме - Exome срещу Transcriptome
Екзоните са кодиращите последователности на гените и определят тРНК последователностите на протеините. Събирането на тези кодиращи последователности (екзони) е известно като екзома на организма. Гените се транскрибират в иРНК молекули, преди да се получат протеини. Общите молекули на иРНК на клетка или тъкан във всеки един момент са известни като транскриптом. Транскриптомът представлява гените, които се експресират активно в иРНК по всяко време. Транскриптомът е специфичен за клетките и тъканите и влияе на условията на околната среда. Това е разликата между екзома и транскриптома.
