Ключовата разлика между генетичната карта и физическата карта е в техниките, използвани при картографирането на генома. При генериране на генетична карта се използват генетични маркери и генетични локуси за изследване на моделите на генна връзка, докато физическото картографиране използва техники на молекулярната биология като полиморфизъм на ограничителната дължина на фрагмента (RFLP) и хибридизационни техники.
Генетични карти и Физически карти два вида карти, които изграждат, за да покажат гените, разположени в хромозомите. Те участват в генетичната диагностика и за прогнозиране на еволюцията по отношение на геномния анализ. Освен това те използват за анализ на разстоянията между генните локуси и за анализ на генните полиморфизми.
