Ключовата разлика между генетичната карта и картата на връзката е типът гени, използвани за процеса на картографиране. Генетичната карта се състои от всички гени, присъстващи в определена хромозома, докато картата на свързване се състои от свързани гени, присъстващи в определена хромозома.
Генетичната карта и картата на връзката са два вида хромозомни карти, които илюстрират гени, открити в хромозомите. Генетичната карта показва всички гени, докато картата на свързване показва само свързаните гени. И двете са много полезни при диагностицирането на генетични заболявания и нарушения. В допълнение, хромозомните отклонения могат също да бъдат открити с помощта на генетични карти и карти на свързване. Картите за свързване допълнително дават представа за еволюцията на определени гени.
