Ключовата разлика между глюкогенните и кетогенните аминокиселини е, че глюкогенните аминокиселини произвеждат пируват или други глюкозни прекурсори по време на техния катаболизъм, докато кетогенните аминокиселини произвеждат ацетил КоА и ацетоацетил КоА по време на техния катаболизъм.
Аминокиселините са основните молекули, които изграждат химическата структура на протеините и полипептидите. Въпреки че има различни класификации на аминокиселините, ние можем да ги класифицираме като глюкогенни и кетогенни аминокиселини в зависимост от междинните продукти, които те образуват по време на техния катаболизъм. Както бе споменато по-горе, крайният продукт от катаболизма на аминокиселините дава два вида междинни продукти; или пируват (или към други предшественици на глюкоза), или ацетил КоА и ацетоацетил КоА.
