Ключовата разлика между първичните и вторичните метаболити е, че първичните метаболити са крайните продукти на метаболизма, които пряко участват в нормалния растеж, развитие и размножаване на организма, докато вторичните метаболити са метаболитите, които не участват пряко в нормалния растеж, развитие и възпроизводство на организъм.
Метаболитите участват в растежа на организмите чрез процеса на метаболизъм. Метаболизмът е сумата от всички биохимични реакции, протичащи в организма. Има две основни категории метаболити в зависимост от произхода и функцията. Те са първични и вторични метаболити.
