Ключовата разлика между протоксилема и метаксилема е, че протоксилема е първата образувана първична ксилема, която има по-малки клетки, особено тесни съдове и трахеиди, докато метаксилема е по-късно образуваната първична ксилема, която има по-големи клетки, особено по-широки съдове, и трахеиди.
Ксилем е един от двата вида съдови тъкани в растенията. Ксилем провежда движенията на вода и минерали нагоре от корените към другите части на растението. Това е подобна на тръба структура, съдържаща различни видове специализирани клетки, включително съдови елементи, трахеиди, паренхим и влакна. Има два вида ксилеми като първична и вторична ксилема. Първичната ксилема се развива по време на първичен растеж. Освен това първичният ксилем има две части: протоксилем и метаксилем. Както протоксилема, така и метаксилема произхождат от прокамбия по време на първичния растеж. Протоксилемът произхожда първо, а метаксилемът произхожда след протоксилема.