Ключовата разлика между ацидофилните и базофилните е, че ацидофилните компоненти на клетката са киселинолюбиви и за тяхното оцветяване се използват киселинни багрила, докато базофилните компоненти на клетката не обичат основата, а основните оцветители се използват за оцветяването им.
Оцветяването е техника, използвана за визуализиране на клетките и техните компоненти, тъй като много клетки са безцветни и прозрачни. Някои компоненти на клетката са киселинолюбиви, докато някои части обичат основата. Киселинните бои и основните багрила са два вида багрила, които често се използват в процедурите за посочване. Базофилното оцветяване използва основни багрила, докато ацидофилното оцветяване използва киселинни багрила. Следователно, ацидофилните или киселинно-обичащите компоненти се свързват с киселинни багрила, докато базофилните или базовите компоненти се свързват с основни багрила.