Ключовата разлика между ЯМР и рентгеновата кристалография е, че ЯМР е аналитична техника, използвана за определяне на вида и броя на атомите в органична молекула, докато рентгеновата кристалография е аналитична техника, използвана за определяне на атомната и молекулната структура на кристала.
Терминът ЯМР означава ядрено-магнитен резонанс. Този термин попада под субтопичната спектроскопия в аналитичната химия. Рентгеновата кристалография, от друга страна, е вид кристалографска техника, при която използваме рентгенов лъч за анализ на кристали.