Ключовата разлика между R и S конфигурацията е, че R конфигурацията е пространствената подредба на R изомера, която има своята относителна посока на приоритетен ред по посока на часовниковата стрелка, докато S конфигурацията е пространствената подредба на S изомера, която има своята относителна посока на приоритет поръчка в посока, обратна на часовниковата стрелка. Тук относителната посока на приоритетния ред е низходящия ред на приоритетите на заместителите.
R и S изомерите са органични молекули с хирален център, който е въглероден атом, който има четири различни заместители, прикрепени към него. Тези заместители се изброяват според техния приоритет (приоритетът се определя с помощта на CIP правила, както е описано по-долу).
