Ключовата разлика между Matlab и C език е, че Matlab е интерактивна изчислителна среда, докато C език е език за програмиране с общо предназначение на високо ниво. Освен това Matlab се използва най-вече за научни и инженерни задачи и е платен софтуер, докато езикът C е с общо предназначение и е с отворен код.
Matlab е среда, която помага да се извършват математически изчисления като решаване на диференциални уравнения, изчисляване на интегриране, решаване на полиноми и др. Той предоставя различни команди за извършване на трансформации като Фурие, Лаплас, обратен Лаплас и за създаване на различни графики. От друга страна, C е език за програмиране с общо предназначение на високо ниво. Използва се за разработване на вградени системи, бази данни, операционни системи, компилатори и мрежови драйвери.