Основната разлика между колиформите и ентеробактериите е, че колиформите са група грамотрицателни, пръчковидни и ферментиращи лактоза бактерии, докато ентеробактериите са голямо семейство грамотрицателни бактерии.
Индикаторни организми са организмите, които използват като знаци за обозначаване на определена ситуация. Те показват наличието на нещо, което не е нормално. Колиформите и ентеробактериите са индикаторни бактерии, които показват признака на санитарното качество на храната и водата и също така показват условията на околната среда. Нещо повече, всички колиформи принадлежат към Enterobacteriaceae, но всички членове на Enterobacteriaceae не са колиформи.