Ключовата разлика между екзоскелета и ендоскелета е, че екзоскелетът е външен скелет, присъстващ извън тялото на животно, докато ендоскелетът е вътрешен скелет, присъстващ в тялото на животно.
Тялото на живия организъм, било то медена пчела или човек, е сложна мрежа от различни органи. Тези органи изпълняват няколко собствени функции, освен че са свързани помежду си за хармонично, балансирано и функционално тяло. Всички те са сложни природни чудеса, тъй като всеки вид има своя особеност. Някои имат само ендоскелет, докато други имат само екзоскелет, докато други имат и двете за подкрепа. Както подсказва името, екзоскелетът се намира извън тялото, докато ендоскелетът се намира в тялото. Външният скелет защитава и също така поддържа тялото на животното. От друга страна, ендоскелетът осигурява подкрепа и защита както на вътрешните по-меки, така и на крехки органи като сърце, бели дробове и бъбреци и т.н.