Ключовата разлика между хомологията и сходството в биоинформатиката е, че хомологията се отнася до твърдение за общ еволюционен произход на две последователности, докато сходството се отнася до степента на подобие между две последователности.
Биоинформатиката е научна област, която съчетава биология, информационно инженерство, компютърни науки, математика и статистика за анализ и интерпретация на биологични данни. Хомологията и сходството са два термина, които използваме в областта на биоинформатиката. Можем лесно да изчислим сходството като процент на подобни остатъци по дадена дължина на подравняването. Не можем обаче да изчислим хомологията, тъй като тя може да бъде вярна или невярна и обикновено зависи от използваната хипотеза.
