Ключовата разлика между цитоплазменото наследяване и ядреното наследяване е, че цитоплазменото наследяване се извършва от гени, присъстващи в цитоплазматичните органели, докато ядреното наследяване се извършва от гени, присъстващи в хромозомите.
Оплождането е сливане на мъжки и женски гамети заедно. Следователно, по време на оплождането, хаплоидните сперматозоиди и хаплоидните яйцеклетки се обединяват и образуват диплоидна зигота. Сперматозоидите пренасят ядрото си в яйцеклетката за сливане. Получената зигота има цитоплазмата на яйцеклетката. С прости думи, цитоплазмата на яйцеклетката се превръща в цитоплазма на зиготата. Освен това, потомството получава гени както от ядрата, така и от гените на цитоплазмените органели на майката. Гените на ядрата и гените на цитоплазмените органели се наследяват от потомството. Следователно има два вида наследяване, възникнали по време на сексуално оплождане. Те са цитоплазматично наследство и ядрено наследяване.