Ключовата разлика между кръвно-мозъчната бариера и кръвно-мозъчната бариера е, че кръвно-мозъчната бариера е бариерата, която разделя кръвната тъкан и мозъчната тъкан, докато кръвно-мозъчната бариера е функционална бариера, която разделя кръвната тъкан и цереброспиналната течност.
Кръвно-мозъчната бариера и кръвно-ликворната бариера са две защитни бариери в мозъка. Също така, те са важни при транспортирането на молекули през мозъка и периферните кръвни тъкани. Освен това и двете бариери имат плътни връзки, улесняващи трансфера на нетоксични съединения в мозъка.