Ключовата разлика между CRISPR и рестрикционните ензими е, че CRISPR е естествено срещащ се прокариотен имунен защитен механизъм, който наскоро се използва за редактиране и модификация на еукариотни гени, докато рестрикционните ензими са биологични ножици, които разцепват ДНК молекулите на по-малки вещества.
Редактирането на геноми и модификацията на гени са интересни и иновативни области в генетиката и молекулярната биология. Изследванията на генната терапия широко използват генна модификация. Освен това генната модификация е полезна при идентифициране на свойствата на гена, функционалността на гена и как мутациите в гена могат да повлияят на неговата функция. Важно е да се изведат ефективни и надеждни начини за извършване на точни, целенасочени промени в генома на живите клетки. CRISPR и рестрикционните ензими играят ключова роля в генните модификации. CRISPR модифицира гени с висока точност. Рестрикционните ензими работят като биологични ножици, които разцепват молекулите на ДНК в по-малки вещества.