Ключовата разлика между молекулното докинг и скоринга е, че докингът е техника, използвана за определяне на афинитета на свързване между две молекули, докато точкуването е процес на оценка на определена поза чрез преброяване на броя на благоприятните междумолекулни взаимодействия.
Термините молекулярно докинг и точкуване се използват в областта на молекулярното моделиране. Молекулярното моделиране е техника, използвана за определяне на възможните подредби на различни молекули в дадено вещество. Тази техника е важна при създаването на нови стабилни съединения.
