Ключовата разлика между първичен и вторичен алилен карбокатион е, че първичният алилен карбокатион е по-малко стабилен от вторичния алилен карбокатион.
Алилното карбокатиониране е резонансно стабилизирана въглеродна структура. Това е йон, съдържащ положителен заряд. В тези йони положителният йон се поставя върху алилния въглероден атом (алилен въглероден атом е съседният атом към двойна връзка). Първичен алилен карбокатион е алилен карбокатион, при който положителният заряд се поставя върху първичен въглероден атом, докато вторичният алилен карбокатион е алилен карбокатион, при който положителният заряд се поставя върху вторичен въглероден атом.
