Ключова разлика - гел електрофореза срещу SDS страница
Гелната електрофореза е техника, която разделя макромолекулите в електрическо поле. Често срещан метод в молекулярната биология е отделянето на ДНК, РНК и протеини от смеси според техните молекулни размери. SDS Page е вид гел електрофореза, който се използва за отделяне на протеини от протеинова смес въз основа на техните размери. Гел електрофорезата е термин, използван за означаване на нормалната техника, прилагана за разделяне на ДНК, РНК и протеини, докато SDS Page е един вид гел електрофореза. Това е ключовата разлика между гел електрофорезата и SDS Page.
СЪДЪРЖАНИЕ
1. Общ преглед и ключова разлика
2. Какво е гел електрофореза
3. Какво е SDS страница
4. Равно до сравнение - Гел електрофореза срещу SDS страница
5. Резюме
Какво представлява гел електрофорезата?
Гел електрофорезата е често срещана техника, използвана в лабораториите за отделяне на заредени молекули като ДНК, РНК, протеини и др. От техните смеси. При гел електрофорезата се използва гел. Действа като молекулярно сито. Има два вида гелове, използвани в гел електрофорезата, а именно агароза и полиакриламид. Изборът на гел и гел препарат са важни фактори, които трябва да се имат предвид при гел електрофорезите, тъй като размерът на порите на гела трябва да бъде внимателно манипулиран за добро разделяне на молекулите чрез гел електрофореза. Гелната електрофореза има електрическо поле, свързано с два края на гела. Единият край на гела показва положителен заряд, докато другият край е отрицателно зареден.
ДНК и РНК са отрицателно заредени молекули. След като бъдат заредени в гела от отрицателния край на гела и приложени към електрическото поле, те мигрират през порите на гела към положително заредения край на гела. Скоростта на миграцията зависи от заряда и размера на молекулата. По-малките молекули лесно мигрират през порите на гела, отколкото по-големите молекули. Следователно, по-малките молекули изминават голямо разстояние през гела, а по-големите молекули изминават кратко разстояние. За да се наблюдава движението на молекулите върху гела, се използват специални видове багрила. Електрическото поле се прилага за определен период от време и се спира, за да се предотврати загубата на молекули и да се запазят молекулите в изминатите им позиции. В гела могат да се наблюдават различни ленти. Тези ленти представляват молекулите с различни размери. Следователно,гел електрофорезата е полезна за разграничаване на молекулите според техните размери.
Гел електрофорезата е включена в различни техники като подготвителна техника в молекулярната биология като PCR, RFLP, клониране, ДНК секвениране, Southern blot, картографиране на генома и др.
Фигура 01: Електрофореза в агарозен гел
Какво е SDS страница?
Натриевият додецил сулфат полиакриламиден гел електрофореза (SDS страница) е вид гел електрофореза, използван за разделяне на протеини. Когато се използва гел електрофореза за разделяне на протеини, са необходими специални лечения, тъй като протеините не се зареждат отрицателно като ДНК и РНК и не мигрират към положителния или отрицателния край. Следователно, протеините са денатурирани и покрити с отрицателен заряд преди гел електрофорезата. Това се прави с помощта на детергент, наречен натриев додецил сулфат (SDS). Гелната електрофореза, която използва SDS и полиакриламиден гел за поддържаща среда, е известна като SDS Page. Тази техника се използва често в биохимията, генетиката, криминалистиката и молекулярната биология.
По време на SDS Page, протеините се смесват със SDS. SDS разгръща протеини в линейна форма и ги покрива с отрицателен заряд, пропорционален на тяхната молекулна маса. Поради отрицателния заряд, протеиновите молекули мигрират към края на положителния заряд на гела и се отделят според техните молекулни маси. В SDS Page полиакриламид се използва като твърда подложка за гела. Действителното разделяне на протеините зависи главно от свойствата на гела. Следователно, подготовката на полиакриламиден гел трябва да се извършва внимателно и да се използват правилни концентрации на полиакриламид. Полиакриламидните гелове показват висока разделителна способност от агарозните гелове. Следователно, SDS Page се счита за техника с висока разделителна способност за разделяне на протеини.
SDS Page е вид денатурираща гел електрофореза. Той има основно ограничение в анализа на протеините. Тъй като SDS денатурира протеини преди разделянето, той не позволява откриване на ензимна активност, взаимодействия с протеини, свързващи протеини, кофактори и др.
Фигура 02: Страница на SDS
Каква е разликата между гел електрофореза и SDS Page?
Гелна електрофореза срещу SDS страница |
|
Гелната електрофореза е метод, който се извършва за разделяне на макромолекулите с помощта на електрическо поле. | SDS Page е техника за гел електрофореза с висока разделителна способност, използвана за разделяне на протеини въз основа на тяхната маса. |
Гел бягане | |
Може да се изпълнява хоризонтално или вертикално. | Страницата на SDS винаги работи вертикално. |
Основа за разделяне | |
Разделянето става според заряда и размера. | Разделянето на протеини става според масата и заряда. |
Резолюция | |
Агарозната гел електрофореза има ниска разделителна способност, а полиакриламидната гел електрофореза има по-висока разделителна способност | Страницата SDS има по-добра резолюция. |
Денатурация | |
Гелната електрофореза включва както денатуриращи, така и неденатуриращи техники. | SDS Page денатурира протеини преди разделяне. |
Резюме - Гел електрофореза срещу SDS страница
Гел електрофорезата е често срещана техника, използвана за разделяне и анализ на ДНК, РНК и протеини въз основа на техния размер и заряд. Има два основни типа гел електрофореза, а именно агарозна гел електрофореза и полиакриламидна гел електрофореза. Агарозните гелове се използват главно за разделяне на нуклеинови киселини; когато се изисква по-висока разделителна способност, се използват полиакриламидни гелове. SDS Page е вид гел електрофореза, често използвана за разделяне на сложни смеси от протеини. Той се счита за техника за разделяне на протеини с висока разделителна способност. Това е разликата между гел електрофорезата и SDS Page.