Основната разлика между алфа и бета тубулин е, че алфа тубулинът съдържа Asp-254 на E-мястото, докато бета-тубулинът съдържа Lys-254 на N-сайта. Отделно от това, GTP винаги е прикрепен към субединицата алфа-тубулин, докато при субединицата бета-тубулин, GTP е заменяем за микрофиламентите, за да се полимеризират.
Микротубулите са част от цитоскелета на еукариотната клетъчна цитоплазма. Следователно, микротубулите съществуват като мрежа от протеинови нишки, разпределени в клетката, осигуряващи определена форма на клетката и поддържащи органелите на място. Освен това те се състоят от два основни тубулинови протеина, а именно алфа и бета тубулини. Алфа и бета са две семейства от суперсемейство на еукариотния тубулин. Алфа и бета тубулинът съществува като димер и е основният градивен елемент на микротубулите.