Ключовата разлика между 2D и 3D клетъчната култура е, че 2D клетъчната култура използва изкуствена плоска повърхност, обикновено петриева чиния или плоча за клетъчна култура, докато 3D клетъчната култура използва субстрат, който имитира извънклетъчната матрица от този конкретен клетъчен тип.
Клетъчната култура е процес, който отглежда клетки при контролирани условия, обикновено извън естествената им среда. 2D и 3D клетъчната култура са два вида. Както 2D, така и 3D системите за клетъчни култури са много полезни при in vitro тестване на терапевтични средства, лекарства и други биохимично активни съединения и могат да се разглеждат като алтернатива на изпитванията върху животни. Тези две културни системи се различават една от друга по адхезионната повърхност на клетките.
